В 2007-2016 годах Захарченко систематически получал взятки от организованной группы, которая контролировала несколько компаний, не занимавшихся реальным бизнесом, а совершавших незаконные банковские операции. В группу входили объявленные в международный розыск предприниматели Валерий Маркелов, Борис Ушерович, Иван Станкевич и Дмитрий Моторин.
Захарченко оказывал им покровительство и способствовал тому, чтобы исключить или свести к минимуму возможность их разоблачения.
В 2015 году Захарченко получил от предпринимателя, работающего в сфере топливно-энергетического комплекса, взятку в виде оплаты услуг по проживанию в гостиничных комплексах "Гранд Отель Поляна" и "Поляна 1389 Отель и СПА" на Кубани. Всего Захарченко получил в качестве взяток более 1,4 млрд рублей.
Захарченко был задержан и арестован в сентябре 2016 года по обвинению в воспрепятствовании производству предварительного расследования и получении двух взяток в особо крупном размере. При обыске у него нашли деньги на сумму 8,5 млрд в рублевом эквиваленте. В июне 2019 года экс-полковник был приговорен к 12,5 годам строгого режима и штрафу в размере 118 млн руб.
Имущество Захарченко и его близких в размере 9 млрд руб. было обращено в доход государства.